放弃宁远，带几十万边民入关，不是一件易事，一帮辽东将领包括吴三桂，对崇祯的圣旨很纠结，吴三桂更是面色沉重。宁远城是吴家苦心经营多年的地方，他的舅舅祖大寿降清后，祖家的家产也都交给了吴三桂。如奉召入京勤王，放弃宁远，吴家和祖家几代人的心血就化为乌有。而且宁远城易守难攻，一朝离开，再想从满清手中夺回，无异于与虎谋皮。另外，吴三桂心底还有一个顾虑——每次京师受外敌攻击，事后崇祯皇帝必斩兵部尚书或总兵维护朝廷尊严和自己圣君的面子，满清先后四次内犯时，被崇祯杀掉的兵部侍郎、总督、督师、总兵等军事高官达四十多人，其中就包括著名的督师袁崇焕。
吴三桂心里很纠结，心想即使率关宁军抵达京城杀退李自成，以崇祯皇帝多疑和刚愎自用的个性，自己会不会步袁督师的后尘，这很难说。当年满桂在京城外与后金军队激战，皇太极下令用袁崇焕部下用过的箭矢射伤满桂，结果满桂身中五箭，其中三支贯体，回城后军医取出。满桂中了计，以有袁督师部下记号的箭矢和伤口为证找崇祯告御状，坐实了袁督师的“通敌之罪”。当时吴三桂和舅舅祖大寿陪袁督师进宫面圣，在大殿亲眼看到袁督师蒙冤，被锦衣卫野蛮按倒，强行剥去朝服，这一幕十五年过去了，还历历在目！而且，在崇祯十六年，吴三桂就率军勤王过，等他到了京城，危机早就解除了，白跑了一趟，所以这一次是去是留，吴三桂迟疑不定，让诸将先表态：“诸位都是多年随三桂出生入死的兄弟，有什么话都可以直说！”